Изначально концепция мультсериала была навеяна комиксом Фрэнка Миллера Бэтмен:Возвращение темного рыцаря», фильмами Тима Бертона «Бэтмен» и Бэтмен Возвращается», а также известными мультфильмами Супермен», созданными в 1940х. Брюс Тимм и Эрик Радомски разработали дизайн мультсериала, строго соблюдая гротескную стилистику фильмов Тима Бёртона, создающую «потустороннее отсутствие чувства времени», объединяя такие элементы, как чёрно-белые заставки, полицейские дирижабли (хотя они никогда не существовали, Брюс Тимм предположил, что они хорошо вольются в общую атмосферу того времени), одежду и машины в духе эпохи 40х годов и винтажную» цветовую палитру нуар-фильмов. Первоначально в заглавной теме мультсериала звучала изменённая версия музыки, написанной Дэнни Эльфманом в качестве саундтрека к фильмам Бёртона «Бэтмен» и «Бэтмен возвращается»; позже в сериях была использована новая мелодия, написанная в том же стиле композитором Ширли Уокер (которая иногда помогала Эльфману работать над саундтреками фильмов). Музыка в самом мультсериале была также написана под влиянием работ Эльфмана и Уокер над «Бэтмен» и «Бэтмен возвращается», и музыки из фильмов в стиле «нуар».
Мультсериал был больше ориентирован на взрослую публику, чем предыдущие типичные мультфильмы про супергероев. Стремясь сделать его более «тёмным», создатели мультсериала превысили общепринятые границы мультфильмов в этом жанре: «Бэтмен: мультсериал» стал первым мультфильмом, в котором было изображено огнестрельное вместо лазерного оружия; в серии «Я есть ночь» ( «I Am the Night») комиссар Гордон был показан как единственный человек, действительно раненный в перестрелке; Бэтмен на самом деле бил руками и ногами противников, также присутствовала кровь; в дополнение ко всему, многие фоны в мультсериале были нарисованы на чёрной бумаге. Отличительную визуальную комбинацию нуар-фильмов и дизайна ар-деко с очень тёмной гаммой цвета создатели мультсериала назвали дарк-деко (dark - тёмный). По началу, создатели мультсериала Тимм и Радомски столкнулись с сопротивлением и недовольством со стороны руководства студии, но успех первого фильма Бёртона о Бэтмэне оказал им хорошую поддержку, и была выпущена пилотная серия, которая, по словам Тимма «скинула много людей с наших спин».